全转录组

全转录组

描述

全转录组测序研究非编码RNAmRNA间的靶向调控以及相互作用关系可实现编码RNA和非编码RNA的建库、测序、信息分析及联合分析、ceRNA等,从而快速全面准确地获得与特定生物学过程 (例如发育、疾病等)所有RNA转录本数据信息,通过数据分析将生物调控机制研究延伸到网、多层面结合的立体模式,有助于相对全面解读生物学现象。有如下两种建库方式

a两库全转录组测序:LncRNA-Seq + Small RNA

采用去核糖体链特异性建库模式,进行PE150测序,实现lncRNAmRNAcircRNA鉴定和定量、以及功能分析;采用富集小RNA片段建库方法,进行SE50测序,实现miRNAsiRNA以及piRNA鉴定和定量,以及功能分析等;

b三库全转录组测序:LncRNA-Seq+ Small RNA+ CircRNA

采用去核糖体链特异性建库模式,进行PE150测序,实现lncRNAmRNA、鉴定和定量、以及功能分析;采用去除线性RNA,富集环状RNA建库方法,进行PE150测序,实现对低丰度的环状RNA鉴定和定量及功能分析;采用富集小RNA片段建库方法,进行SE50测序,实现miRNAsiRNA以及piRNA鉴定和定量,以及功能分析等; 
以上两种模式,还可以实现互作网络分析,以及内源竞争性RNA鉴定和网络分析。

 

应用方向

人、小鼠、斑马鱼等胚胎发育、性腺发育、肌肉发育和免疫调控生命过程研究植物逆境响应、器官发育、生殖生长和病毒侵染等研究肿瘤、精神疾病、代谢病、心血管病、免疫病等疾病发生与诊治研究。

 

检测流程:

图片.png

送样要求:

样品类型

样本要求 

备注

新鲜动物组织

900mg

脂肪等 RNA 得率低的组织 2 g 以上

新鲜植物组织

1500mg

含水量大的组织 2 g 以上

新鲜培养细胞

2*107

去除培养基

新采集的全血

6ml

血液样本送样签加入EDTA抗凝管,推荐使用BD管送样

Total RNA建库起始量

≥3ug≥5ug

两库全转:≥3ug; 三库全转:≥5ug

 


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