16S/18S/ITS rDNA包含可变区和保守区,原核微生物的16S rDNA基因长度约为1500bp,真核微生物18S rDNA基因长度约为1500-2000bp,真核生物ITS全长为300-1000bp。全长扩增子(16S/18S/ITS)测序基于Pacbio长读长测序平台,获得注释到“种”的分类鉴定!不仅可以提高物种鉴定分辨率,还可以通过全长序列进行准确的物种注释,从而更加真实地还原样本中微生物的群落结构。
样本类型 | 二代种水平比例 | 三代种水平比例 |
土壤 | 10%-20% | 60%-70% |
人粪便 | 20%-30% | 60%-70% |
口腔拭子 | 15%-20% | 60%-70% |
动物粪便 | 10%-20% | 60%-70% |
应用方向
细菌多样性研究:16S全长
真菌多样性研究:ITS全长
真核微生物多样性研究:18S全长
功能基因研究:反硝化细菌nirS、固氮菌nifH等
检测流程:
送样要求
样本类型 | 建议送样量 | 最低送样量 |
土壤/污泥/沉积物/腐殖质 | 3-5g | 1g |
水体滤膜 | 2-3 张 | 1张 |
拭子 | 3-5 个 | 1 个 |
瘤胃液/发酵液/组织液 | 3-5mL | 1mL |
粪便/肠道内容物 | 3-5g | 1g |
动物/人组织 | 1-3g | 1g |
血浆 | 3-5mL | 1mL |
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