全长16S/18S/ITS测序(三代)

全长16S/18S/ITS测序(三代)

描述

16S/18S/ITS rDNA包含可变区和保守区,原核微生物的16S rDNA基因长度约为1500bp,真核微生物18S rDNA基因长度约为1500-2000bp真核生物ITS全长为300-1000bp全长扩增子(16S/18S/ITS)测序基于Pacbio长读长测序平台,获得注释到的分类鉴定!不仅可以提高物种鉴定分辨率,还可以通过全长序列进行准确的物种注释,从而更加真实地还原样本中微生物的群落结构。

 

样本类型

二代种水平比例

三代种水平比例

土壤

10%-20%

60%-70%

人粪便

20%-30%

60%-70%

口腔拭子

15%-20%

60%-70%

动物粪便

10%-20%

60%-70%

应用方向

细菌多样性研究:16S全长 
真菌多样性研究:ITS全长 
真核微生物多样性研究:18S全长 
功能基因研究:反硝化细菌nirS、固氮菌nifH

 

检测流程

 

图片.png

 

送样要求

 

样本类型

建议送样量

最低送样量

土壤/污泥/沉积物/腐殖质

3-5g

1g

水体滤膜 
(孔径 0.22-0.45μm/直径 3-4cm

2-3

1

拭子

3-5

1

瘤胃液/发酵液/组织液 
(离心有明显沉淀)

3-5mL

1mL

粪便/肠道内容物

3-5g

1g

动物/人组织

1-3g

1g

血浆

3-5mL

1mL

 


微信扫描关注我们
工作时间: 周一至周五 9:00-18:00

联系人:吴经理

手机:18217791420

邮件:info@tgenebiotech.com

地址:上海市闵行区新骏环路188号19栋2层;上海市闵行区剑川路951号5幢1层