空间转录组测序可以提供研究对象的转录组等数据信息,同时还能定位其在组织中的空间位置,将转录组 信息与空间位置信息相结合,为检测组织中的细胞空间组成与基因表达提供了强有力的手段。
10× Visium空间转录组结合组织学的形态观察优势和转录组学的高通量测序优势,完成对一张组织切片的多个位点的高通量测序。该技术借助高通量测序数据和组织原位barcode标记构建空间表达图谱,解释不同组织位置的异质性,实现了从基因表达到组织区域的对生命表型特征的全面解析,为细胞微环境、细胞间信号通路和空间异质性研究提供了全新的解决方案。
应用方向:
Ø 组织原位表达图谱构建;
Ø 空间异质性分析;
Ø 肿瘤微环境研究;
Ø 疾病病理进程研究;
Ø 发育生物学。
检测流程:
1)新鲜组织
2)FFPE组织样本
送样要求:
样本类型 | 取样方法 | 质量要求 | 保存运输 |
新鲜组织 | 新鲜组织取样后立即进行OCT包埋处理,然后液氮速冻,-80℃保存。如无法立即进行包埋处理,则先将组织用干冰速冻后再进行OCT包埋。 | RNA的 RIN值≥7,组织H&E染色完整、无明显空隙。 | 干冰运输 |
FFPE组织 | 建议将FFPE组织在固定和包埋后存储在4℃,以确保RNA的完整性。 | RNA的DV200 > 30%,组织H&E染色完整、无明显空隙。 | 常温或冰袋运输 |
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